例えば、POPFileのようなソフトを用いて複数アカウントのメールを受信前にフィルタし、スパムメールのみToヘッダを書き換え、特定のアカウントに集中させる、といった指定ができれば解決できそうです（残念ながらPOPFileのマニュアルではToヘッダの修正機能は見つかりませんでした）。
何か方法は無いでしょうか？
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私は「becky!」利用ですが、spamフォルダを使用しないで、ゴミ箱に直接振り分ければ新着の太文字は出ません。
また、spamとゴミ箱のメールを分別したいのであれば、ゴミ箱の中にspamフォルダを作成します。
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Welcome to Gmail
私がやっている方法を紹介します。
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複数のメールアカウントで、それぞれをGmailに転送するように設定します。
メールクライアントからはGmailアカウントを利用する設定（POP）を行うことで、SPAM対処済みのメールのみにアクセスできます。
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どのようなメールがSPAM扱いされたかは、Gmailにログインして確認することが出来ます。私のアカウントには1日100～200通のSPAMが届くのですが、SPAMの誤判定は1日に1通あるかないかです。
なるほど。ただ、これは管理しているメールアカウント分だけGMailアカウントを取るって事ですよね?て事は、SPAM判定されたメールを確認する時に何度もGMailにログインしないといけない気が・・最低でも週に1度はチェックしないとマズいので、その手間が微妙かも、です。
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んー、なるほど。直接ゴミ箱は無理ですが、ゴミ箱の中にspamフォルダはありかも。
と思ったのですが、使用している秀丸メールではゴミ箱の中にフォルダを作る事も、逆にフォルダの中にゴミ箱を入れる事もできないようです。惜しい。。