ウェブ受注システム作成先を探しているのですが、（価格コムなどで販売している家電卸サイトのように受注と発送時の送り状通知機能を備えた物）、

ある人にとって良い発注先が他の人にとっては良くない発注先である、ということが良くありますから、一概には答えにくいと思います。

答えになっていないのですが、質問者の方にとって必要な機能を明確にリストアップした上で、複数の会社に相見積もりをとってはいかがでしょうか。

その際は、過去の実績、契約形態と契約書の中身、支払方法、瑕疵担保の対応なども業者から出して貰うとよいでしょう。

そんなの面倒だな～、という場合はパッケージソフトやASPサービスを選択するという手もあります。

安いのはロリポップのcolor-meというサービスですね。小商店向けです。