PHP MySQL ver5~

class Database{
.....

function userdata($id,$permission){
if(!ctype_......値の確認
$res = $db->Execute("select * from `data` where `user`=? and `per`=?", array($id,$per));
if($res->RecordCount() == 0){ return false; }
return $res->FetchRow();
}

function .....

上記の部分は下記のような設計であるべきだと思います。

class Database{
.....

$sql = "select * from `data` where `user`=? and `per`=?", array($id,$per);

function userdata($id,$permission,$sql){
    if(!ctype_......値の確認
        $res = $db->Execute($sql);
        if($res->RecordCount() == 0){ return false; }
    return $res->FetchRow();
}

function .....

DRY (Do not repeat yourself.)です。

これだけなら修正は簡単だと思いますよ。

class Database2 というのを作ってテストしていけば良いと思います。

（１）

＞プログラマーは私一人しかいませんので

＞私がコードを熟知していれば問題ありません。

信頼に応えられるようにしておく必要があるのではないでしょうか。

病気や怪我はいつ起こるか判りませんよね。

あなた一人だけの会社であったとしても

整理してあれば、クライアントが受ける被害は少なくて済むでしょうし

復帰した際も、また受け入れてもらえる事でしょう。

そのためには、紙による資料も

しっかり整えてあるかどうか確認しておくと良いでしょう。

処理フロー、スクリプトリスト、スクリプトの概要などなど・・・

（詳細設計書までは作ってないかもしれませんが

せめて外部設計資料くらいは欲しいところですね）

（２）

＞セキュリティや負荷など

昨今のパソコンの能力向上は目を見張るものがありますので

パフォーマンスが多少悪くても整理整頓されたコードのほうが

長い目で見れば有効な手段となりえます。

整理整頓されたなかで、どうしてもパフォーマンスを

重視しなければならない部分が出てきても

その部分だけをチューニングするのは比較的簡単な話であって

仮にその部分だけコーディングがイレギュラーになったとしても

それは仕方がないという話もできますよね。

ところが、全体的に整理がいまいちできてないとなると・・・

チューニングどころの話ではなくなります。

（セキュリティに関しても同様ですね）

同じようなコードが多々あるのならば

数種類のパターンに分類して、例えば、

function userdata($id,$permission,$sqlno){

といった具合に$sqlnoでＳＱＬを選択できるようにしておくなど

工夫の余地は沢山あると思いますし、このような方法であれば

それほど多くの手間もかからないと思います。

（あまりにもコードが混乱しているようであれば

整理も兼ねて１から作り直したほうが早い場合もありますね）

（３）

＞既存のフレームワークを仕えなどはNG

フレームワーク、すなわち「作業の枠組み」が揃っていれば

今回のような質問にもならない訳ですよね。

自分で枠組みを作れないなら既存のものを使って枠組みについて学ぶ

もしくは、枠組みをそのまま使うのは必然ではないでしょうか？

当初から長期的目線で開発とスキルアップを続けてきたのであれば

問題無いと思いますけど、失礼ながら数年前の質問投稿から

人的（上記１）、技術的（上記２）両面からみて、それほど

スキルアップしているようには見えませんので

嫌がらずに一度はフレームワークをしっかり学習してみてください。