パソコンを新しく購入しました。以下のような構成にしたのですが、どういう使い方が良いでしょうか?

基本的な使用方法はそれでよいかと思います。

SSDが新しい世代のものであれば、ファイルの保存の時に同じ場所に保存せず、空き領域に保存するようになっているはずですので、

書き込み回数をそれほど気にすることはしなくてよいというのが、本で書かれていたりします。

私であれば、MLCかHDDなのですが、どれぐらいの容量を使うかによってきめてはいかがでしょうか？

動画等を頻繁に保存・削除することがあるのであればHDDに私はするかもしれません。

また、ちょっと気になるのがデスクトップサーチを使うのであれば、あれってバックグラウンドで色々書き込みをしてるっぽいのと、

SSDに関してはデフラグはあまり意味をなさないらしい（空き領域のデフラグはそれなりにいいらしいですが）ので、

するならHDDだけにしとくと、SSDの寿命も延びるかと思います。

ssdを2台使い分けてもあまり意味はないと思いますよ。

読み出し中心のファイルをssd、書き換えが多い部分をHDで十分と思います。

SSDの耐久性はメーカー値よりかなり低めに見積もる必要もあり、SLCだからと言って過信は禁物です。

で、何をHDへ振り分けるべきか、ですが、マイドキュメントは当然にしても、問題はOSのキャッシュファイルです。

テンポラリフォルダ（アプリのも含めて）とIEのキャッシュ、仮想メモリは簡単に設定できるのでHDへ移すべきでしょう。

問題は休止のためのhiberfil.sys（xp）で、これは簡単には動かせず、レジストリで移動するとうまく復帰できなかったり色々問題が出るようです。

ssdで起動が早くなれば休止を無効にしてもいいですが、、、

＞My Documentsなど更新が多いユーザーのフォルダーはどこに格納したら良いかと考えてしまいます。

HDDにおいてください。

SSDは、構造上 ランダムアクセスが圧倒的に高速なのですが、

書き換え回数のほかに書き込み処理が遅いというデメリットがあります。

そのため、OSやプログラムのように一度インストールしたら後は読み込みが中心になるものは

SLCのSSD上にインストールするといいと思います。

MyDocumentのように一般的なデータは、参照と更新の割合やファイルサイズもまちまちで

SSDのメリットを必ずしも生かせるわけではないので、HDDにインストールされてはと思います。

MLCのSSDについては、デスクトップサーチのインデックスやメールデータなどの保存先をMLCに保存されるといいと思います。

デスクトップサーチのインデックス作成はバックグラウンド処理なので、MLCの書き込み性能が低くても意識することはないでしょうし、

検索するときには SSDのランダムアクセスの高速さを生かせると思います。

メールもいったん受信してしまえば、読み返すことはあっても 受信したメールを書き換えたりとかはまずないと思うので、

SSD上に保存して多くといいと思います。