現在、理系の修士２年で、修士論文の締め切りがあと約一ヶ月と少しくらいですが、

＞もし、指導教授が審査の段階で味方にならなかった場合、どのくらい卒業の審査に影響するのでしょうか？

ぜんぜん駄目

＞自分は助教の意見に従ってこれまで研究を進めてきましたが、教授とは意見が合わず、例え話で「違う宗教」とまで言われています。

合わないのは問題ないですが、ようは結果ですな。

＞修論を発表しても卒業できない、ということはどのくらい現実的に起こるのでしょうか？

修論がひどくない限り、卒業できないことはほぼありえない。

基本的には論文のストーリーができているか。理系の場合実験があるから、仮説のとおりにデータが出なかった場合、どういうまとめかたをするかまで考えてあるか、くらいだと思います。

ただ、教授、助教授の問題はやっかいというか、学生にとって迷惑ですね。

それによって可不可まではいたらないと思いますが、優・良あるいは良・可くらいはちがってくる可能性はあります。しかし、それは学生側はどうしようもないので、甘受するしかないです。どうころんでも、大丈夫なように努力するしかないでしょう。

理不尽といえば理不尽ですが、世の中の組織の大半はそんなものなので、公正明大にできているのが普通だと思わない方がよいです。卒論なんて小さい問題の方だし。

まともに実験をやって、枚数もそれなりに書いてあれば不可なんてことは滅多にありません。ま、すくなくとも形式上ケチをつけられないくらい（枚数が少なすぎるとか、手書きで乱雑極まりないとか）は努力してください。

理系修士卒でメーカーに勤めて3年目のものです。過去の卒業生が留年した等の情報があればわかりやすいと思います。私が所属していた研究室は、研究バリバリでしたが、研究室に週３ぐらいきて、修論間際に実験してどうしようもないデータで卒業した人もいます。単純に、当たり前ですが修士は学士よりまともな資料と発表内容があれば卒業できると思います。当時は私も提出間際にテンパって目の前の修士論文発表に恐怖を感じながらやっていましたが、卒業してしまえばたいしたことないです。当時は国際学会や論文提出と頑張りましたが、真面目にやるだけ無駄だったなと感じています。

今の仕事に直接関係ない研究でしたので、もっと適当にやって学生らしい遊びや友人との関係を大切にするべきだったと少し後悔しているぐらいです。ただ研究室という小さな環境では、どんな宗教（教授の色？）に染まっているのかは、外部の私にはわかりませんが。どこも似たような感じなのでしょうか？ちなみに、うちの研究室の教授と助教授も仲が悪かったです。その中で、真面目に研究していた学生は、強い意志を持った学生だけだったような気がしています。

いまでは、大学の先生も学生をタダでこき使っているなーとしか思っていないです。新卒で入社直後に国際学会や論文を出したりがんばったんだと今の会社の上司にいったら、お前騙されたんだなと言われたぐらいです。研究室の予算獲得のためにやらされたんだろ。って言われましたね。いい経験にはなりましたが、たしかにタダ働きをしたなーという感は今でも残っています。お金をもらっていない学生ですので、あせるのはもったいないです。仕事で奉仕ぐせをつけるとサービス残業にもっていかれやすいので、やれる範囲で修士卒を目指すほうが得です。

こんな駄目意見ですが、駄目でしょうか？

　心配御無用、安心して下さい。一般に、修論で落とされることはほとんどありません。結果が出ないとなかなか通らないのは、博士論文の方です。

　私などは、初め狙っていたこととは、逆の実験結果が出てしまい、事実をありのままに報告しただけで、何の成果も出なかったので不安でしたが無事通りました。もしかして、先生が一所懸命かばってくれたのかな。(^_^;

　毎日、学校に行って、実験して、単位をとって、発表会をこなして、修論を形式を整えて提出すれば、落とされることはまずないと思っても大丈夫です。修論は、結果じゃなくて、過程を評価しているのじゃないでしょうか。

修士論文の場合は、教授の意見が一番効きます。

その研究室で、今までに落ちた人が一人でもいたら結構危険です。

落とす場合には、良いデータが出たかどうかより、頑張っていたかサボっていたかを判断基準にすることが多いようです。