ルパン三世の上着って、昔緑でしたよね？

アニメを作るときって、企画を作った人がパイロットフィルムというお試し版を作って、

偉い人に見てもらって、番組化するかどうかを決めてたんだ。

で、最初のルパン三世（緑の上着）のときのパイロットフィルムが、これ。

http://video.fc2.com/content/200910084hHDa3Nr/

見れば分かるけど、このときの上着が赤なのね。

声優も、緑ルパンの時は二階堂有希子に変わったけど、パイロットフィルムでは

赤ルパンの増山江威子だったり。

というのが、理由じゃないかな、と思います。

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http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%AB%E3%83%91%E3%83%B3%E4%B8%89%E4%B8%96_%28TV%E7%AC%AC2%E3%82%B7%E3%83%AA%E3%83%BC%E3%82%BA%29

Wiki には、こんなことが書いてありますね。

ルパンのジャケットの色が違う。『TV第1シリーズ』を「青ジャケ」「緑ジャケ」と呼ぶのに対し、こちらは「赤ジャケ」と呼ばれる。大塚康生によるとジャケットの色が変わった理由はスポンサーであるバンダイの商品が緑のままだと旧作のスポンサーである浅田飴の商品と区別がつかなくなる恐れがあったからだそうである[1]。

出典は、「東京ムービーアニメ全史」なんですと。

因みに、最初のやつでも、後半のオープニングがパイロットフィルムから

映像を流用してたので、赤ルパンが一瞬見られたりします。