うつ病で自立支援医療受給証を支給されている患者がいます。習慣的に飲酒していますが、自立支援医療が毎年更新されています。

仰る通り納得はいかない部分ではありますね。
ただ、この制度は病院側も旨味を得ている所が根が深いです。公費によって医療費が賄われるということは取りっぱぐれないという点があるのです（踏み倒しを防ぐとか）。自分のお金がどんどん減るなら患者は高額な医療に躊躇しますが、税金で賄われるということはバンバンお金を使っても許容されます。一面では、病院・医師側もこの制度で儲けているという側面があるので一筋縄にはいかない問題ですね。

自分で保険を掛けている場合であれば、その保険契約に基づいて保険給付が行われます。
社会保険であれば、社会保険制度に基づいて保険給付が行われます。
自立支援医療制度であれば、制度の定めるところに基づいて給付（自己負担軽減）が行われます。
精神作用物質使用による精神及び行動の障害（例：アルコール依存症、薬物依存症など）であれば、当然にして制度での支援がなされます。
患者の自立を支援するという視点に立てば、薬物依存＆うつなどから脱却出来ずにいて、生活困難者の場合、経済的支援を必要とするという認定になるのは当然です。
http://www.pref.fukushima.jp/seisinsenta/jiritu/jiritu_iryou.html
上記のサイトの中に経済的条件と申請更新時の様式２（診断書兼「重度かつ継続」に関する意見書）があるので見てください。
http://www.mhlw.go.jp/seisakunitsuite/bunya/hukushi_kaigo/shougaishahukushi/jiritsu/dl/03.pdf
医療費を稼げるという事実もあるでしょうが、うつなどの場合他に合併症を持っているのはポピュラーですし、簡単に脱却出来るのならうつなどにならないことも多いです。うつで経済的困難を抱えていればその患者や家族はとてつもなく大変な状況になっていることはほぼ確実です。支援をしてもとても楽にはなれないし、治療もなかなか進まないハズです。もしも支援をしなければ、悲惨な事態になるケースが続発するでしょう。向精神薬依存症が増えているとの報道もありますが、こうした方は依存しないとやっていけない面もあるので、アルコール飲酒は治療に善くないと云ったところで、なにも解決、改善には繋がりません。医療や社会福祉は、最悪に転落していくのを押しとどめるということがネライのことも多いのです。　良くならないなら止めちゃえとは、思わないのが基本です。　
｢本物のうつ病であれば、酒を飲む意欲すらなくなるはずだから｣と考えるのも間違いです。うつや精神障害の実態に関する理解をする機会が少ないのかもしれませんが、うつや精神障害の場合、数年程度ではどうにもならないことは多いのです。
医療機関などにとって仕事になるかどうかで云うなら、ガンや高血圧、脳研肝障害、心臓病、膠原病、インフルエンザ、腰痛、排尿障害何でも仕事になります。難病や新興感染症が恐れられれば、それだけ医療は増加します。これを、｢一面では、病院・医師側も儲けている｣といえます。他の一面では、患者や家族、高齢者は、そうした人に医療や介護、支援をして欲しいと思っているのです。
こういう状況を｢患者さんを治すことより医療費を稼ぐことに目的がシフトしている｣とは云いません。需要があるから供給があり、仕事があるのです。

現行の制度で問題はなく、他の方のコメントでも、医師が見れば初診30分、再診5分でも医者が見ているのだから誤診の可能性などあるはずもない、依存をするひとは適切な医療を受けられていないのではなくその人が依存しなくてはならない人であるなど、新鮮な意見でした。現行の制度で、日本は全く問題がないということもわかってよかったです。僕としては、かなりの驚きでした。