pukiwikiの改造について質問です。アンカーを見出しの手前に持ってきたいです。どのようにすれば良いでしょうか？

見出し記法の処理付近にある $text . $anchor の順序を入れ替えます。
ファイルは lib/convert_html.php

lib/convert_html.php

		（中略）

	function getAnchor($text, $level)

		（中略）

		// Add heading
		return array($text . $anchor, $this->count > 1 ? "\n" . $top : '', $autoid);

				↓

		// Add heading
		return array($anchor . $text, $this->count > 1 ? "\n" . $top : '', $autoid);

<h2 id="content_1_2">
<a class="anchor_super" id="h01ho2g3e">†</a>
ここに見出し
</h2>

…になってしまいますが、アンカーを前にすることはできます。
（バージョンは PukiWiki Plus! 1.4.7plus-u2-i18n）