VMなどは使わない想定として、サーバー構築（RHEL系）で質問です。再構築をする必要があったとき、再構築前と同じ状態にするためにインストールしたRPMは保存していますか。あとRPMはyumで入れていますか？RHELの公式パッケージダウンロードサイトから入れていますか？

再構築前と同じ状態にするためにインストールしたRPMは保存していますか。

しない。

RPMはyumで入れていますか？

はい。

RHELの公式パッケージダウンロードサイトから入れていますか？

可能な限り。

どうしても足りないものは、

1. 開発元が用意しているリポジトリが無いかを探す。
2. EPEL から探す。
3. 信頼できそうなリポジトリを使う。
4. 自前でパッケージングする。

といった感じ。

自分の管理しているサーバに関しては、Kernel や glibc の様に再起動が必要なアップデートが出たタイミングで、アップデート作業をスケジューリングして、全パッケージを対象にアップデートをかけているので、後生大事に構築時にパッケージを取っておいても、自分の所では無意味なので。

　まったく同じ環境がほしいなら、構築終了段階で、RAID-1ディスクの一方を外して保管してはいかがでしょうか?
　自分のときは、DNSとかNTPとかのインフラでしか使わなかったので、RAIDコントローラが死んだら最新版で再構築してました。

どうしても、再構築に同じ状態にする必要があるのなら、商用だと Symantec Ghost や Drive Image、無償のだと Clozilla のようなソフトで、ディスクイメージを取っておくかなぁ。

rpm パッケージだけの問題なら、インストールした rpm パッケージの一覧を取っておけば、yum でバージョン指定でインストールできるから、rpm のファイルそのものを取っておく必要性は感じない。

最悪、オフラインで復元する必要があるなら考えるけど、それでも一覧さえあれば、必要になった時にオンラインのマシンでダウンロードして、メディアに移してオフラインのマシンに持っていく、とするなぁ。