うごメモのフォルダのデータが消えることはありますか？

私はうごくメモ帳３Dでよく絵を描いたりします。うごメモ３DでGIFを作ったので、それをPCに移そうとSDカードをPCにいれ、GIFをPCに移しました。
そのあとSDカードを抜き３DSに戻してうごメモを起動したところ、一つフォルダが消えていました。
SDカードをPCにさし、データの中から探してみましたが、どこにも見つからず、削除しちゃったのかと思いゴミ箱の中を探したり、PCのデータの中からも探してみたのですが、らしいものは見当たりません。
うごメモのフォルダはどのようなデータで構成されているのですか？また突然消えることはありうるのでしょうか。復元はできますか？大切なフォルダなのでどうにかしたいです。
SDカードの容量は残りわずかで、GIFをとりだしたフォルダとはまったく別です。