OS X 環境下で以下のコマンドを実行すると、最終行が消去されずに出力されます。

こんな感じで。

find ./ -name '*.js' -type f | xargs -n1 sed -i -e '$d'

find の -exec を使っても。

find ./ -name '*.js' -type f -exec sed -i -e '$d' {} \;

以下、参考URL。

• sedでファイルを上書き保存
• sed(1) Mac OS X Manual Page
• Man page of XARGS

    "$d"

は、ダブルクォートでくくられているので、シェル変数 d の内容を展開する、というようにシェルに解釈されます。
d なんていう変数は設定していないはずなので、空文字として sed に渡されます。

$d を sed へのコマンドとして正しく渡すためには、シングルクォートで括ってあげる必要があります。

    '$d'

というわけで、先に回答に書いたコマンドの例もこっそり直しておきました　:-)

sed に "-i "オプションをつければOKです

find ./ -name '*.js' -type f | xargs sed -i .bak "$d"

これは sed の仕様で，たとえば

sed "$d" hogehoge.txt

を実行すると，結果は画面に表示されるだけで，hogehoge.txt の内容は書き換わりません

sed の"-i"オプションを使って

sed -i .bak  "$d" hogehoge.txt

を実行すると hogehoge.txt の内容が書き換わります
さらに元のファイルは .bak が付与されて hogehoge.txt.bak という名前で保存されます