iPhoneの画面を割ってしまい、アップル以外のところで修理しました。

iphoneにはマイクが複数ついてます

確かiphone6までは3個，iphone6sだと4個です．
具体的な個数とかマイクの位置は，web で"iphone6 マイク 位置"とかで検索してみてください．

不具合の原因として考えられることの一つは，これらマイクの取り付けミスです．
つまり一部のマイクが取り付けミスで動作しておらず，その結果，そのマイクに依存しているアプリの動作だけがおかしくなるケースです．

iphoneの修理法は，壊れた部品を丸ごと交換する方式です．つまり，

1. 割れた画面を部品ごと外して
2. 画面の部品につながっているマイクを一度外して
3. そのマイクを新しい画面の部品に付けて
4. 画面を戻す

という作業をしてます．この過程で，マイクの取り付けをミスると
例えばマイクの配線が外れてしまって，そのマイクだけ音が拾えない，という
残念なことが起きます．

Appleのホームページにマイクのテスト方法などが記載されているページがあります．
まずはこの情報に従って個別にマイクをテストしてみるのはいかがでしょうか？
https://support.apple.com/ja-jp/HT203792

これである程度は原因が絞り込めます．原因が絞り込めたら修理を依頼した業者に相談ですかね？運が良ければマイクの配線（コネクタ）を付け直すだけで治るので，作業時間は20分ぐらい，修理代は取られないかもしれません．